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苹果手机短信提醒两次就消失的原因可能有以下几种。
1、短信被自动过滤或删除：iPhone的短信可能被某些设置或应用程序自动过滤或删除，某些第三方短信应用程序可能会自动删除一些短信，或者手机可能被设置为自动删除旧短信，如果使用了iCloud备份并同步设备，可能在另一台设备上已经删除了这些短信。
2、短信推送出现问题：可能是由于信号不稳定或网络延迟导致的短信推送延迟或重复推送，当信号恢复或网络稳定时，之前的短信会再次推送，导致重复提醒，如果手机开启了短信通知的重复提醒功能，也可能导致多次提醒。
3、手机系统问题：可能是手机系统出现bug导致的短信提醒异常，此时可以尝试重启手机或更新系统来解决该问题。
针对以上原因，可以尝试以下解决方案：
1、检查短信是否被过滤或删除，如果是，请更改相关设置或检查第三方应用程序。
2、确保信号稳定或在网络良好的环境下查看短信，关闭重复提醒功能以避免多次提醒。
3、尝试重启手机或更新系统以修复可能的系统问题。
如果问题仍然存在，建议联系苹果官方客服寻求帮助。